¿Se puede estandarizar la vida? Desafíos actuales en la estandarización de la biología

Autores/as

  • Juli Peretó Universitat de València (España).
  • Manuel Porcar Instituto de Biología Integrativa de Sistemas I2SysBio (Universitat de València – CSIC).

DOI:

https://doi.org/10.7203/metode.11.15981

Palabras clave:

dependencia del contexto, modularidad, ruido, promiscuidad, biología sintética

Resumen

El concepto de estándar nos remite poderosamente a la idea de máquinas, industrias, dispositivos eléctricos o mecánicos, vehículos o muebles. De hecho, nuestra civilización tecnológica no sería posible –al menos en los términos en los que está estructurada hoy en día– sin componentes universales y fiables cuyo uso generalizado permite alcanzar costes competitivos y asegurar que los productos sean más robustos y sus componentes, más intercambiables. Por ejemplo, un tornillo del Ikea se puede utilizar en toda una serie de muebles estructuralmente diferentes, y una aplicación se puede ejecutar en muchos smartphones distintos. El propio concepto de estandarización está vinculado con la revolución industrial y la producción masiva de bienes en cadenas de montaje. La pregunta que trataremos de responder en el presente documento es hasta qué punto se pueden alcanzar estándares e implementar un proceso de estandarización en el ámbito biológico.

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Biografía del autor/a

Juli Peretó, Universitat de València (España).

Catedrático de Bioquímica y Biología Molecular de la Universitat de València (España), miembro numerario del Institut d’Estudis Catalans y socio fundador de Darwin Bioprospecting Excellence, SL (Parque Científico de la Universitat de València). Explica metabolismo a los estudiantes de biotecnología y, como miembro del grupo de Biotecnología y Biología Sintética, sus intereses investigadores incluyen la bioprospección, la modelización metabólica y la historia de las ideas sobre el origen natural y la síntesis artificial de vida.

Manuel Porcar, Instituto de Biología Integrativa de Sistemas I2SysBio (Universitat de València – CSIC).

Investigador de la Universitat de València (España) en el grupo de Biotecnología y Biología Sintética del Instituto de Biología Integrativa de Sistemas I 2 SysBio (Universitat de València – CSIC) y presidente de Darwin Bioprospecting Excellence SL (Parque Científico de la Universitat de València). Entre los campos que investiga está la bioprospección en ambientes hostiles a la búsqueda de microorganismos de interés industrial, así como varios aspectos del desarrollo de la biología sintética como disciplina emergente. Actualmente es el coordinador del proyecto europeo H2020 BioRobooST que agrupa veintisiete instituciones públicas y privadas de Europa y seis socios de Asia y América con el objetivo de impulsar un proceso internacional de estandarización en biología sintética.

Citas

Amos, M., & Goñi-Moreno, A. (2018). Cellular computing and synthetic biology. In S. Stepney, S. Rasmussen, & M. Amos (Eds.), Computational Matter (pp. 93–110). Springer.

Arnold, F. H. (2019). Innovation by evolution: Bringing new chemistry to life (Nobel acceptance speech). Angewandte Chemie International Edition, 58(41), 14420–14426. http://doi.org/10.1002/anie.201907729

D’Ari, R., & Casadesús, J. (1998). Underground metabolism. BioEssays, 20(2), 181–186. http://doi.org/10.1002/(SICI)1521-1878(199802)20:2%3C181::AID-BIES10%3E3.0.CO;2-0

De Crécy-Lagard, V., Haas, D., & Hanson, A. D. (2018). Newly-discovered enzymes that function in metabolite damage-control. Current Opinion in Chemical Biology, 47, 101–108. http://doi.org/10.1016/j.cbpa.2018.09.014

Ellens, K. W., Christian, N., Singh, C., Satagopam, V. P., May, P., & Linster, C. L. (2017). Confronting the catalytic dark matter encoded by sequenced genomes. Nucleic Acids Research, 45(20), 11495–11514. http://doi.org/10.1093/nar/gkx937

Elowitz, M. B., & Leibler, S. (2000). A synthetic oscillatory network of transcriptional regulators. Nature, 403(6767), 335–338. http://doi.org/10.1038/35002125

Elowitz, M. B., Levine, A. J., Siggia, E. D., & Swain, P. S. (2002). Stochastic gene expression in a single cell. Science, 297(5584), 1183–1186. http://doi.org/10.1126/science.1070919

Khersonsky, O., & Tawfik, D. S. (2010). Enzyme promiscuity: A mechanistic and evolutionary perspective. Annual Review of Biochemistry, 79, 471–505. http://doi.org/10.1146/annurev-biochem-030409-143718

Kittleson, J. T., Wu, G. C., & Anderson, J. C. (2012). Successes and failures in modular genetic engineering. Current Opinion in Chemical Biology, 16(3-4), 329–336. http://doi.org/10.1016/j.cbpa.2012.06.009

Kizer, L., Pitera, D. J., Pfleger, B. F., & Keasling, J. D. (2008). Application of functional genomics to pathway optimization for increased isoprenoid production. Applied and Environmental Microbiology, 74(10), 3229–3241. http://doi.org/10.1128/AEM.02750-07

Martínez-García, E., Goñi-Moreno, A., Bartley, B., McLaughlin, J., Sánchez-Sampedro, L., Pascual del Pozo, H., Prieto Hernández, C., Marletta, A. S., De Lucrezia, D., Sánchez-Fernández, G., Fraile, S., & de Lorenzo, V. (2019). SEVA 3.0: An update of the Standard European Vector Architecture for enabling portability of genetic constructs among diverse bacterial hosts. Nucleic Acids Research, 48(D1), D1164–D1170. http://doi.org/10.1093/nar/gkz1024

Moradigaravand, D., Palm, M., Farewell, A., Mustonen, V., Warringer, J., & Parts, L. (2018). Prediction of antibiotic resistance in Escherichia coli from large-scale pan-genome data. PLOS Computational Biology, 14(12), e1006258. http://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1006258

Nicholson, D. J. (2019). Is the cell really a machine? Journal of Theoretical Biology, 477, 108–126. http://doi.org/10.1016/j.jtbi.2019.06.002

Porcar, M., Latorre, A., & Moya, A. (2013). What symbionts teach us about modularity. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 1, 14. http://doi.org/10.3389/fbioe.2013.00014

Vilanova, C., & Porcar, M. (2014). iGEM 2.0–refoundations for engineering biology. Nature Biotechnology, 32, 420–424. http://doi.org/10.1038/nbt.2899

Vilanova, C., & Porcar, M. (2019). Synthetic microbiology as a source of new enterprises and job creation: A Mediterranean perspective. Microbial Biotech­nology, 12, 8–10. http://doi.org/10.1111/1751-7915.13326

Vilanova, C., Tanner, K., Dorado-Morales, P., Villaescusa, P., Chugani, D., Frías, A., Segredo, E., Molero, X., Fritschi, M., Morales, L., Ramón, D., Peña, C., Peretó, J., & Porcar, M. (2015). Standards not that standard. Journal of Biological Engineering, 9, 17. http://doi.org/10.1186/s13036-015-0017-9

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Publicado

21-01-2021

Cómo citar

Peretó, J., & Porcar, M. (2021). ¿Se puede estandarizar la vida? Desafíos actuales en la estandarización de la biología. Metode Science Studies Journal, (11), 75–81. https://doi.org/10.7203/metode.11.15981
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  • Resumen
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Número

Science's structures (2021)

Sección

Estándares. Las piezas de la complejidad

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